Les réseaux sur lesquels s’appuie ILICO contribuent tous, par leur domaine de recherche et d’observation spécifique, à améliorer les connaissances des écosystèmes et des espaces littoraux et côtiers. La qualité des réseaux présents au sein de l’IR est assurée via des labellisations attribuées par les «commissions spécialisées» du CNRS Terre et Univers comme « Service National d’Observation » (SNO), «Code Communautaire» (CC) et Parc d'Instruments Nationaux (PIN).
Si ILICO n’a pas vocation à labelliser elle-même les services qu’elle fédère, il lui est possible d’accompagner la labellisation de certains services labellisés.