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Présentations du mardi (Assemblée Générale) et du mercredi (discussions scientifiques inter PPR)
2023_10_25 - Pres_S4_2_ILICO_IA_COPPOLA_RN_biogeochimie_marine
2023_10_25 - Pres_S4_2_ILICO_IA_COPPOLA_RN_biogeochimie_marine
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Pres_S4_2_ILICO_IA_COPPOLA_RN_biogeochimie_marine
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Assemblée Générale - Colloque Annuel
Année du Colloque / Assemblée Générale
2023
Auteur(s)
Coppola L
Description du document / information complémentaire
L’usage de l’apprentissage automatique (“machine learning”) en océanographie : exemple d’applications des réseaux de neurones dans le domaine de la biogéochimie.
Type de ressource
- Support de présentation
Si autre, précisez
Liens projets structurants : PPR Ocean et Climat
Si une ou plusieurs Action(s) concernée(s), préciser.
- Action 7 : Approche intégrée
- Autre
Si autre, quelle(s) action(s) ?
Liens projets structurants : PPR Ocean et Climat
Si un ou plusieurs laboratoires est / sont concerné(s), préciser
- LOV
Lien vers référence / ressource web
https://cloud.ifremer.fr/index.php/s/ChoAEgCHtz8y0Qu
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- Ne connait pas les droits d'utilisation
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2023
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10
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25
2023_10_25 - Pres_S4_2_ILICO_Eveillard_OMICS2ecosystem_status
2023_10_25 - Pres_S4_2_ILICO_Eveillard_OMICS2ecosystem_status
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Pres_S4_2_ILICO_Eveillard_OMICS2ecosystem_status
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Assemblée Générale - Colloque Annuel
Année du Colloque / Assemblée Générale
2023
Auteur(s)
Eveillard D
Description du document / information complémentaire
From omics to ecosystem status : Towards a modern analysis of omics of the Oceans
Type de ressource
- Support de présentation
Si autre, précisez
Liens projets structurants : PPR Ocean et Climat
Si une ou plusieurs Action(s) concernée(s), préciser.
- Action 7 : Approche intégrée
- Autre
Si autre, quelle(s) action(s) ?
Liens projets structurants : PPR Ocean et Climat
Si un ou plusieurs laboratoires est / sont concerné(s), préciser
- Autre laboratoire / autre affiliation (mon laboratoire n'apparait pas dans la liste ci dessous)
Lien vers référence / ressource web
https://cloud.ifremer.fr/index.php/s/Ba7TGxp57yE3FAm
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- Ne connait pas les droits d'utilisation
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2023
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10
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25
2023_10_25 - Pres_S4_1_ILICO_Irisson_machine_learning
2023_10_25 - Pres_S4_1_ILICO_Irisson_machine_learning
Titre du document
Pres_S4_1_ILICO_Irisson_machine_learning
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Assemblée Générale - Colloque Annuel
Année du Colloque / Assemblée Générale
2023
Description du document / information complémentaire
Vue historique de l'utilisation du machine learning en écologie marine
Type de ressource
- Support de présentation
Si autre, précisez
Liens projets structurants : PPR Ocean et Climat
Si une ou plusieurs Action(s) concernée(s), préciser.
- Action 7 : Approche intégrée
- Autre
Si autre, quelle(s) action(s) ?
Liens projets structurants : PPR Ocean et Climat
Si un ou plusieurs laboratoires est / sont concerné(s), préciser
- Autre laboratoire / autre affiliation (mon laboratoire n'apparait pas dans la liste ci dessous)
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https://cloud.ifremer.fr/index.php/s/4MStwNd6XTrzxld
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2023
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25
2023_10_25 - Pres_S3_3_ILICO_Huret_Ernande_HTL
2023_10_25 - Pres_S3_3_ILICO_Huret_Ernande_HTL
Titre du document
Pres_S3_3_ILICO_Huret_Ernande_HTL
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Assemblée Générale - Colloque Annuel
Année du Colloque / Assemblée Générale
2023
Auteur(s)
Ernande B, Huret M
Description du document / information complémentaire
Modélisation intégrée des hauts niveaux trophiques (HTL) dans le PPR MEDIATION
Type de ressource
- Support de présentation
Si autre, précisez
Liens projets structurants : PPR Ocean et Climat
Si une ou plusieurs Action(s) concernée(s), préciser.
- Action 7 : Approche intégrée
- Autre
Si autre, quelle(s) action(s) ?
Liens projets structurants : PPR Ocean et Climat
Si un ou plusieurs laboratoires est / sont concerné(s), préciser
- Autre laboratoire / autre affiliation (mon laboratoire n'apparait pas dans la liste ci dessous)
- MARBEC
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https://cloud.ifremer.fr/index.php/s/sDVonKAENvp2107
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2023
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10
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25
2023_10_25 - Pres_S3_2_ILICO_modelisation_biogeochimique_ULSES
2023_10_25 - Pres_S3_2_ILICO_modelisation_biogeochimique_ULSES
Titre du document
Pres_S3_2_ILICO_modelisation_biogeochimique_ULSES
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Assemblée Générale - Colloque Annuel
Année du Colloque / Assemblée Générale
2023
Auteur(s)
Ulses et al.
Description du document / information complémentaire
Modélisation des grands cycles biogéochimiques et contaminants
Elena Alekseenko (LOG), Melika Baklouti (MIO),
Mathilde Cadier (IFREMER), Martin Plus (IFREMER), Marc
Sourisseau (IFREMER), Caroline Ulses (LEGOS)
Elena Alekseenko (LOG), Melika Baklouti (MIO),
Mathilde Cadier (IFREMER), Martin Plus (IFREMER), Marc
Sourisseau (IFREMER), Caroline Ulses (LEGOS)
Type de ressource
- Support de présentation
Si un ou plusieurs laboratoires est / sont concerné(s), préciser
- Autre laboratoire / autre affiliation (mon laboratoire n'apparait pas dans la liste ci dessous)
- LEGOS
- LOG
- MIO
Lien vers référence / ressource web
https://cloud.ifremer.fr/index.php/s/CDjZRVNQkr1Qcje
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- Ne connait pas les droits d'utilisation
Année de publication du document (pour faciliter recherche)
2023
Mois de publication du document (pour faciliter recherche)
10
Jour de publication du document (pour faciliter recherche)
25
Restitutions des actions co-financées par ILICO
Stage : Valorisation des données des SNO BenthOBS et PHYTOBS
Stage : Valorisation des données des SNO BenthOBS et PHYTOBS
Année (budget - AO)
2023
Type de financement
- Stages
Rappel montant demandé
4000
Montant alloué
4000
Prise en charge OFB
- non
Texte long
Demande de financement de stage
Rapport de stage
2023-07-12 Date de fin
Rapport de stage
2023-07-12 Date de fin
Lieu de l'évènement
Roscoff
Stage : Dynamique des ondes IG en conditions paroxymales
Stage : Dynamique des ondes IG en conditions paroxymales
Année (budget - AO)
2023
Type de financement
- Stages
Rappel montant demandé
4000
Montant alloué
4000
Prise en charge OFB
- non
Début évènement
09.01.2023
Fin évènement (si plusieurs jours)
05.07.2023
Texte long
Exploiter les données de pression de fond de mer collectées dans le cadre du SNO DYNALIT pour mieux comprendre la dynamique des ondes infra-gravitaires en conditions paroxysmales.
Lier au rapport de stage lorsque disponible.
Lier au rapport de stage lorsque disponible.
Lieu de l'évènement
La Rochelle
Séminaire scientifique : Outre-Mer Pacifique
Séminaire scientifique : Outre-Mer Pacifique
Année (budget - AO)
2023
Type de financement
- Actions prioritaires
Rappel montant demandé
10000
Montant alloué
10000
Prise en charge OFB
- non
Début évènement
14.03.2023
Fin évènement (si plusieurs jours)
17.03.2023
Nombre de participants (présentiel)
36
Nombre de participants (distanciel)
6
Texte long
Intervenants institutionnels (dans l’ordre d’intervention) : Benoit Soulard (représentant Ifremer NC), Morgan Mangeas (DUA Entropie IRD), Julien Simon (Directeur SHOM NC), Olivier Pringault (Directeur département OCEAN IRD), France Bailly (représentante IRD NC), Anne Rouault (Chargée de mission auprès de la présidente de l’UNC)
Programme et support de présentations : https://doi.org/10.5281/zenodo.7796742
Programme et support de présentations : https://doi.org/10.5281/zenodo.7796742
Lieu de l'évènement
NOUMEA
REVOLECO
REVOLECO
Type de financement
- AST
Prise en charge OFB
- oui
Début évènement
08.07.2019
Fin évènement (si plusieurs jours)
11.07.2019
Nombre de participants (présentiel)
14
Texte long
REVOLECO : Ruptures dans l’évolution à long terme des écosystèmes côtiers
Lors du colloque EVOLECO 2017, de nombreuses présentations scientifiques ont fait état, dans les séries de données à long terme présentées, de l’existence d’un point de rupture entre le milieu des années 90 et le milieu des années 2000. Ces séries portaient sur des paramètres et des compartiments très divers (climat, paramètres hydrologiques, structure des communautés zooplanctoniques ou macrozoobenthiques, isotopie de la macrofaune benthique, etc…) et sur des sites et empreintes géographiques diverses allant d’un écosystème à l’ensemble du littoral national selon les paramètres ou les compartiments.
Dans ce contexte général, nous avons lancé l’action REVOLECO dont les objectifs sont, suite à l’identification des jeux de données présentant une rupture entre mi-90 et mi-2000, 1) la comparaison des méthodes statistiques permettant la mise en évidence de telles ruptures, 2) la mise en relation des jeux de données afin d’identifier leurs liens éventuels et 3) la mise en évidence des causalités et des mécanismes associés.
Le co-pilotage de l’action REVOLECO est maintenant assurée par Eric Thiébaut (Sorbonne Université), Cédric Bacher (Ifremer) et Eric Goberville (Sorbonne Université)
Suite à un appel à manifestation d’intérêt, 31 personnes se sont déclarées intéressées par l’atelier. 14 ont pu y participer (voir ci-dessous)
La première demi-journée a été consacrée à des présentations (voir ci-dessous). Les quatre demi-journées suivantes ont été consacrées à des séances de co-working, généralement en binôme, ponctuées de synthèses et de discussions collectives. Ces demi-journées ont constitué le cœur de l’atelier. Elles ont eu pour objectif majeur de tester les différents outils statistiques sur des séries temporelles de fréquence (hebdomadaire, mensuelle, annuelle), de durée (une à plusieurs décennies) et de nature (paramètres environnementaux, taxa) différentes. La dernière demi-journée a été consacrée à un bilan à chaud de l’atelier et à des prospectives concernant la suite à donner à REVOLECO.
Le compte-rendu de l’atelier incluant un descriptif de chaque outil et une bibliographie succincte est accessible
Contexte et objectifs de REVOLECO
Lors du colloque EVOLECO 2017, de nombreuses présentations scientifiques ont fait état, dans les séries de données à long terme présentées, de l’existence d’un point de rupture entre le milieu des années 90 et le milieu des années 2000. Ces séries portaient sur des paramètres et des compartiments très divers (climat, paramètres hydrologiques, structure des communautés zooplanctoniques ou macrozoobenthiques, isotopie de la macrofaune benthique, etc…) et sur des sites et empreintes géographiques diverses allant d’un écosystème à l’ensemble du littoral national selon les paramètres ou les compartiments.
Dans ce contexte général, nous avons lancé l’action REVOLECO dont les objectifs sont, suite à l’identification des jeux de données présentant une rupture entre mi-90 et mi-2000, 1) la comparaison des méthodes statistiques permettant la mise en évidence de telles ruptures, 2) la mise en relation des jeux de données afin d’identifier leurs liens éventuels et 3) la mise en évidence des causalités et des mécanismes associés.
Le co-pilotage de l’action REVOLECO est maintenant assurée par Eric Thiébaut (Sorbonne Université), Cédric Bacher (Ifremer) et Eric Goberville (Sorbonne Université)
Atelier REVOLECO – juillet 2019
Un premier atelier s’est principalement focalisé sur le premier objectif.Organisation et déroulement
L’atelier a été co-financé par le RESOMAR et l’AFB. Il a été co-organisé par Eric Thiébaut (Sorbonne Université), Cédric Bacher (Ifremer) et Nicolas Savoye (Université de Bordeaux).Suite à un appel à manifestation d’intérêt, 31 personnes se sont déclarées intéressées par l’atelier. 14 ont pu y participer (voir ci-dessous)
La première demi-journée a été consacrée à des présentations (voir ci-dessous). Les quatre demi-journées suivantes ont été consacrées à des séances de co-working, généralement en binôme, ponctuées de synthèses et de discussions collectives. Ces demi-journées ont constitué le cœur de l’atelier. Elles ont eu pour objectif majeur de tester les différents outils statistiques sur des séries temporelles de fréquence (hebdomadaire, mensuelle, annuelle), de durée (une à plusieurs décennies) et de nature (paramètres environnementaux, taxa) différentes. La dernière demi-journée a été consacrée à un bilan à chaud de l’atelier et à des prospectives concernant la suite à donner à REVOLECO.
Présentations
- Présentation de l’atelier, de sa genèse, des attentes et synthèse des jeux de données des participants par les organisateurs.
- Retour sur l’atelier ‘série chronologiques’ (29-31/10 2018) par Dominique Soudant (Ifremer)
- Quelques méthodes de détection des changements écosystémiques abrupts par Eric Goberville (Sorbonne Université)
- Les modèles hiérarchiques multivariables pour mieux comprendre les changements de régimes par Guillaume Blanchet (Université de Sherbrooke au Canada)
- Utilisation des DLM (Dynamic Linear Model) dans la détection de ruptures Dominique Soudant (Ifremer)
- Dynamique temporelle de la biodiversité : vers la détection d’alarmes précoces de l’impact du changement global ?par David Carayon (IRSTEA)
Participants
Maïa Akopian (Agence Française pour la Biodiversité), Elvire Antajan (Ifremer), Cédric Bacher (Ifremer), Guillaume Blanchet (Université de Sherbrook), Henrique Cabral (IRSTEA), David Carayon (IRSTEA), Eric Goberville (Sorbonne Université), Francis Gohin (Ifremer), Arnaud Lheureux (Université de Bordeaux), Maud Pierre (IRTSEA), Nicolas Savoye (Université de Bordeaux), Dominique Soudant (Ifremer), Eric Thiébaut (Sorbonne Université), Dorothée Vincent (Agence Française pour la Biodiversité).Outils testés
Les différents outils testés sont : Rodionov-stars et équivalents (T-tests), DLM (Dynamic Linear Model), AEM (Asymmetric Eigenvector Maps), MHM (Modèles Hiérarchiques Multidimensionnels), Ondelettes.Compte-rendu
Le compte-rendu de l’atelier incluant un descriptif de chaque outil et une bibliographie succincte est accessible
Lieu de l'évènement
Jussieu Paris 75005
EVOLECO 2021
EVOLECO 2021
Année (budget - AO)
2021
Type de financement
- AST
Montant alloué
10000
Prise en charge OFB
- non
Début évènement
02.11.2021
Fin évènement (si plusieurs jours)
05.11.2021
Nombre de participants (présentiel)
147
Nombre de participants (distanciel)
NA
Texte long
Site EVOLECO 2021 (sciences conf)
Lieu de l'évènement
2 rue Olympe de Gouges, La rochelle
EVOLECO 2017
EVOLECO 2017
Type de financement
- AST
Début évènement
05.12.2017
Fin évènement (si plusieurs jours)
07.12.2017
Texte long
Le colloque EVOLECO 2017 s’est déroulé du 5 au 7 décembre 2017 sur le campus de l’Université de Bordeaux à Pessac.
http://www.evoleco-2017.com/
L’objectif du colloque était double : d’une part, dresser un état des lieux de l’évolution à long terme des écosystèmes côtiers et identifier les forçages et les processus associés à travers l’étude de séries chronologiques à l’échelle décennale ; d’autre part, favoriser les interactions des différentes communautés présentes autour de questions scientifiques communes afin de démarrer des collaborations interdisciplinaires et inter-réseaux autour d’outils communs (e.g. analyses statistiques, modèles mathématiques, scénarisation) ou transverses (e.g. télédétection).
Le colloque était organisé en sessions et ateliers.
Session 1 : IR ILICO, services d’observation et réseaux élémentaires
Session 2 : hydrodynamique, hydrodynamique sédimentaire et trait de côte
Session 3 : cycle des nutriments et des éléments biogènes
Session 4 : populations et communautés biologiques
Session 5 : 20 ans SOMLIT
Session 6 : outils et techniques
Atelier 1 : analyse des séries à long terme
Atelier 2 : apports respectifs de la télédétection et des mesures in situ
Atelier 3 : discussions croisées interdisciplinaires
http://www.evoleco-2017.com/
L’objectif du colloque était double : d’une part, dresser un état des lieux de l’évolution à long terme des écosystèmes côtiers et identifier les forçages et les processus associés à travers l’étude de séries chronologiques à l’échelle décennale ; d’autre part, favoriser les interactions des différentes communautés présentes autour de questions scientifiques communes afin de démarrer des collaborations interdisciplinaires et inter-réseaux autour d’outils communs (e.g. analyses statistiques, modèles mathématiques, scénarisation) ou transverses (e.g. télédétection).
Le colloque était organisé en sessions et ateliers.
Session 1 : IR ILICO, services d’observation et réseaux élémentaires
Session 2 : hydrodynamique, hydrodynamique sédimentaire et trait de côte
Session 3 : cycle des nutriments et des éléments biogènes
Session 4 : populations et communautés biologiques
Session 5 : 20 ans SOMLIT
Session 6 : outils et techniques
Atelier 1 : analyse des séries à long terme
Atelier 2 : apports respectifs de la télédétection et des mesures in situ
Atelier 3 : discussions croisées interdisciplinaires
Lieu de l'évènement
Université de Bordeaux Pessac
Colloque EGHYMANCHE 2023
Colloque EGHYMANCHE 2023
Année (budget - AO)
2023
Type de financement
- AST
Rappel montant demandé
4000
Montant alloué
4000
Prise en charge OFB
- non
Début évènement
05.07.2023
Fin évènement (si plusieurs jours)
07.07.2023
Nombre de participants (présentiel)
60
Lieu de l'évènement
wimereux
Atelier NEO : Niche Ecologique Optimale (Couplage entre les Systèmes d’observation nationaux (SNO) en milieu marin)
Atelier NEO : Niche Ecologique Optimale (Couplage entre les Systèmes d’observation nationaux (SNO) en milieu marin)
Année (budget - AO)
2022
Type de financement
- AST
Rappel montant demandé
8405
Montant alloué
8405
Prise en charge OFB
- non
Début évènement
02.05.2023
Fin évènement (si plusieurs jours)
05.05.2023
Nombre de participants (présentiel)
13
Texte long
Lieu de l'évènement
Caen
Atelier Integration : Vagues de chaleur marine 2022
Atelier Integration : Vagues de chaleur marine 2022
Type de financement
- AST
Rappel montant demandé
10000
Montant alloué
10000
Prise en charge OFB
- oui
Début évènement
26.06.2023
Fin évènement (si plusieurs jours)
28.06.2023
Nombre de participants (présentiel)
35
Nombre de participants (distanciel)
20
Texte long
Lieu de l'évènement
Toulouse
Atelier : traitement capteurs de pression
Atelier : traitement capteurs de pression
Type de financement
- AST
Rappel montant demandé
5280
Montant alloué
5280
Prise en charge OFB
- non
Début évènement
18.10.2023
Fin évènement (si plusieurs jours)
19.10.2023
Nombre de participants (présentiel)
17
Lieu de l'évènement
La Rochelle